Từ năm 1993, Trường ĐHKH, Đại học Huế được Bộ GD&ĐT giao nhiệm vụ đào tạo sau đại học. Hơn 20 năm qua, công tác đào tạo sau đại học của Trường đã có những thành tựu vượt bậc. Từ 1 chuyên ngành năm 1993, đến nay Trường đã có 26 chuyên ngành đào tạo thạc sĩ và 17 chuyên ngành đào tạo tiến sĩ. Năm 2017, Trường sẽ đề nghị GD&ĐT Bộ GD&ĐT cho phép mở thêm các chuyên ngành Xã hội học, Công tác xã hội, Quản lý vệ sinh an toàn thực phẩm ở trình độ thạc sĩ và chuyên ngành Triết học, Khoa học môi trường  ở trình độ đào tạo tiến sĩ. Trường ĐHKH là một trong những cơ sở đào tạo có số lượng NCS đông nhất của Đại học Huế. Tính đến tháng 12/2016, tổng qui mô đào tạo Sau đại học của trường ĐHKH gần 550 học viên cao học và  155 NCS. Bên cạnh việc đa dạng hóa ngành nghề đào tạo, tăng qui mô đào tạo, Nhà trường đã có những biện pháp để cải thiện chất lượng đào tạo sau đại học nhằm đáp ứng nhu cầu của xã hội. Không những thế, Trường ĐHKH còn chú trọng mở rộng các hoạt động liên kết đào tạo Sau đại học với các cơ sở đào tạo trong nước, đặc biệt là các tỉnh miền Trung - Tây nguyên, đồng bằng Sông Cửu Long.