Trường ĐHKH hiện đang có 25 chuyên ngành đào tạo thạc sĩ và 17 chuyên ngành đào tạo tiến sĩ. Trường đang có liên kết đào tạo với các trường Đại học An Giang, Đại học Trà Vinh, Đại học Đồng Tháp, Đại học Cửu Long, Đại học Kinh tế - công nghiệp Long An; ở khu vực Tây Nguyên, Trường triển khai tuyển sinh trên diện rộng, đặc biệt là các tỉnh Gia Lai, Đắk Lắk, Đắk Nông, Kon Tum trên tinh thần đa dạng hóa các chuyên ngành đào tạo và hỗ trợ tối đa cho học viên. Ngoài ra, Trường đang có liên kết đào tạo với Trường Đại học Savannakhet, CHDCND Lào đào tạo thạc sĩ chuyên ngành Khoa học môi trường; Học viện Cảnh sát nhân dân đào tạo thạc sĩ tội phạm học và ngăn ngừa tội phạm.Trường tiếp tiếp tục đặt cơ sở đào tạo tại các Trường Đại học ở các tỉnh kinh tế trọng điểm miền Trung (Đà Nẵng, Quảng Nam, Quảng Ngãi, Bình Định) nhằm tăng cường hợp tác và đào tạo nguồn nhân lực có trình độ cao phục vụ phát triển kinh tế - xã hội của địa phương.

Tính đến tháng 11/2019, tổng qui mô đào tạo Sau đại học của trường ĐHKH gồm 901 học viên cao học và 120 NCS. Năm học 2018 – 2019 đã có 12 NCS bảo vệ thành công luận án cấp cơ sở và 16 nghiên cứu sinh bảo vệ thành công luận án tiến sĩ cấp ĐHH và 373 học viên cao học bảo vệ thành công luận văn thạc sĩ.

Bên cạnh việc đa dạng hóa ngành nghề đào tạo, tăng qui mô đào tạo, Nhà trường đã có những biện pháp để cải thiện chất lượng đào tạo sau đại học nhằm đáp ứng nhu cầu của xã hội như đào tạo đội ngũ giảng viên có trình độ cao (trong tổng số 284 giảng viên có 03 giáo sư, 38  phó giáo sư, 83 tiến sĩ, và hơn 40 giảng viên cao cấp); đã hoàn thành và đưa vào sử dụng khu thực hành thí nghiệm, biên soạn nghiệm thu, xuất bản giáo trình dùng cho hệ đào tạo Sau đại học. Trong đào tạo tiến sĩ, Trường đã chú trọng nâng cao chất lượng đào tạo, tăng cường công tác quản lý, nâng cao chất lượng của các buổi bảo vệ luận án tiến sĩ cấp cơ sở và cấp Đại học Huế. Các Khoa, Bộ môn chuyên môn tăng cường các hoạt động seminar, sinh hoạt học thuật giúp học viên cao học và NCS có cơ hội mở mang kiến thức và nâng cao trình độ. Hhàng năm Nhà trường công nhận tốt nghiệp và cấp bằng cho hơn 300 học viên cao học và hơn 20 nghiên cứu sinh.